Les commissions de Bourges Plus sont des groupes de travail. Elles couvrent l'ensemble des compétences exercées par la communauté d'agglomération, elles font des propositions au Bureau et au Conseil.
Elles se réunissent avant chaque conseil communautaire.
À ces commissions de travail s'ajoutent 4 instances relevant d'une obligation légale : la Commission d'Appel d'Offres (CAO), le Comité Technique (CT), le Comité d'Hygiène et de Sécurité (CHS) et la Commission Locale d'Evaluation des Charges Transférées (CLECT).